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UMR botAnique et bioinforMatique de l’Architecutre des Plantes

Discipline : Botanique, Mathématique et Informatique appliquées

Mots-clés : Botanique, systématique, écologie, architecture des plantes, mathématiques appliquées, informatique, agronomie, foresterie, peuplements végétaux, modélisation et simulation.


Personnel de l’équipe résident en Guyane :

 

  • Chercheurs :
  • - Delprete Piero G., CR2 IRD, HDR                                                                 piero.delprete@ird.fr
  • - Leroy Céline, CR2 IRD                                                                                   celine.leroy@ird.fr

 

  • Ingénieurs :
  • - Frame Dawn, IR CNRS (CDD),                                                                          dawn.frame@ird.fr
  • - Gonzalez Sophie, IE2 IRD,                                                                        sophie.gonzalez@ird.fr

 

  •  Techniciens :
  • - Bilot-Guérin Véronique, Technicienne IRD,                                                  veronique.guerin@ird.fr
  • - Giniez Chantal, Technicienne IRD,                                                                 chantal.giniez@ird.fr
  • - Smock Jean-Louis, Technicien IRD,                                                           jean-louis.smock@ird.fr
  • - Tarcy Michel, Technicien IRD,                                                                          michel.tarcy@ird.fr

 

 

Personnel de l’équipe en visite en Guyane :

  • [Christophe Proisy]  CR IRD                                                   christophe.Proisy@ird.fr

Thème de recherche :

 

  • Description des thèmes de recherche :
  • L’Unité Mixte de Recherche (UMR) “botAnique et bioinforMatique de l’Architecture des Plantes” (AMAP) associe plus de 70 agents permanents de plusieurs organismes (Cirad-Cnrs-Inra-Ird-Université Montpellier 2) dont certains sont affectés en outremer (Guyane, Nouvelle Calédonie) ou à l’étranger (Inde, Cameroun).Elle est organisée en 3 équipes et ses recherches mettent en jeu des disciplines variées – botanique, écologie, mathématiques appliquées, informatique, dont l’association et la complémentarité constituent un enjeu scientifique et technique majeur pour l’agronomie, la botanique et la foresterie modernes.Les recherches accordent une place centrale à la description, l’analyse et la modélisation de la structure, de la dynamique de développement et de la diversité des plantes et des peuplements végétaux.

 

  • Elles privilégient les approches génériques, communes à l’ensemble des plantes, annuelles ou pérennes, actuelles ou fossiles, sauvages ou cultivées, tempérées, méditerranéennes ou tropicales.Elles concernent la mesure, la représentation, l’analyse et le traitement des données, la simulation informatique, l’organisation et la gestion des connaissances.

 

  • Missions :
  • - Elaborer des programmes de recherche visant à enrichir la connaissance de la flore et du fonctionnement des écosystèmes guyanais.
  • - Assurer la diffusion des connaissances afin de venir en appui aux élus locaux ainsi qu’aux gestionnaires des espèces et des espaces protégés dans le cadre des politiques de gestion du territoire.
  • - Offrir un appui à la formation en botanique et en écologie, tant pour les enseignants du primaire et du secondaire que pour les étudiants de l’enseignement supérieur.
  • - Répondre à des demandes d’expertise diverses de la part des acteurs locaux.

 

  • Compétences spécifiques et savoir-faire :
  • Systématique et Taxinomie, Floristique, Ecologie forestière, Architecture des plantes, Modélisation, Biomécanique. Gestion de collections et de dispositifs d’inventaire. Collecte de données sur le terrain (forêt, savane).

 

 

  • Equipement spécifique :
  • L’Herbier IRD de Guyane (180 000 spécimens de plantes collectées en Guyane, mais aussi dans d’autres pays du Bouclier Guyanais, Guyana et Surinam notamment) est une plateforme de recherche et d’expertise sur la biodiversité végétale.Comme tout laboratoire de recherche, son accès est controlé, et réservé prioritairement aux chercheurs, étudiants et experts accrédités.La station de recherche de l’IRD de la Piste de St Elie est un dispositif de terrain comprenant de nombreuses parcelles permanentes pour l’étude de la biodiversité végétale forestière guyanaise, et un campement aménagé pour l’accueil des chercheurs et étudiants. Il peut également accueillir des visiteurs non scientifiques sur demande, en fonction des disponibilités.

 

 

Partenariat et réseaux :

 

  • Régional :
  • - Parc Amazonien de Guyane (caractérisation de la flore et de la végétation, structure et composition)
  • - Parc naturel régional de la Guyane (PNRG)
  • - DEAL Guyane (révision des ZNIEFF, établissement de la liste des plantes des zones humides)

 

  • National :
  • - Museum National d’Histoire Naturelle de Paris (MNHN)

 

  • International :
  • - Instituts brésiliens (Museu Goeldi, Embrapa, IEPA). Mise en place par Piero Delprete, CR à l’Herbier de Guyane, d’un réseau des herbiers de la Guyane, de l’Amapá et du Pará (réseau GAP).
  • - Réseaux botaniques : Le réseau de spécialistes « Flora of the Guianas » produit et édite la flore des Guyanes depuis 1985.
  • - Pl@ntNet : Le projet Pl@ntNet, initié par l’UMR AMAP en collaboration avec l’INRIA et Tela Botanica, et financé par la fondation Agropolis à hauteur de 3 millions d’euros, a démarré en Octobre 2009. Objectif : favoriser l’accumulation de connaissances et d’expertises en botanique par la création d’une plateforme associant amateurs, chercheurs et professionnels.

 

Publications significatives :

 

  • 2013 :

  • - Dejean A, Orivel J, Rossi V, Roux O, Lauth J, Malé PJ, Céréghino R, Leroy C. Predation success by a plant-ant indirectly favours the growth and fitness of its host myrmecophyte. PLoS One. 2013;8(3):e59405. [article]
  • - Dézerald O, Leroy C, Corbara B, Carrias JF, Pélozuelo L, Dejean A, Céréghino R. Food-web structure in relation to environmental gradients and predator-prey ratios in tank-bromeliad ecosystems. PLoS One. 2013 Aug 14;8(8):e71735 [article]
  • - Leroy C, Carrias JF, Corbara B, Pélozuelo L, Dézerald O, Brouard O, Dejean A, Céréghino R. Mutualistic ants contribute to tank-bromeliad nutrition. Ann Bot. 2013 Sep;112(5):919-26
  • - Nicolini E., Beauchene J.  Crown development and annuel longitudinal/radial growth pattern in Parkia velutina (Mimosoïdeae), an emergent tree of neotropical rain forests. Annals of Forest Science 69:543- 555. (IF-2011 : 1,788).

 

  • 2012 :

  • - Baraloto, C.; Hérault, B.; Paine, T.; Massot, H.; Blanc, L.; Bonal, D.; Nicolini, E.; Molino, J.F.; Sabatier, D. (2012). Contrasting taxonomic and functional responses of a tropical tree community to selective logging. Journal of Applied Ecology 49 (4), 861–870.
  • - Colin F, Sanjines A, Fortin M, Bontemps JD, Nicolini E. Fagus sylvatica trunk epicormics in relation to primary and secondary growth. Ann Bot. 2012 Oct;110(5):995-1005. [article]
  • - Laurans M., G. Vincent, E. Nicolini, O. Martin. (2012). Functional traits and their plasticity predict tropical trees regeneration niche even among species with intermediate light requirements. Journal of Ecology 100 (6), 1440–1452.
  • - Letort V., P. Heuret, P.C. Zalamea, P. de Reffye, E. Nicolini. 2012. Analysing the effects of local environment on the source-sink balance of Cecropia sciadophylla: a methodological approach based on model inversion. Annals of Forest Science 69:167-180.
  • - Nicolini E., J. Beauchêne, B. Leudet, J. Ruelle, T. Mangenet, P. Heuret. 2012. Crown development and annual longitudinal/radial growth pattern in Parkia velutina Benoist (Mimosoïdeae), an emergent tree of neotropical rain forests. Annals of Forest Science 69:543-555.
  • - Zalamea P.-C., Heuret P., Rodriguez M., Berthouly A., Sarmiento C., Nicolini E., Guitet S., Delnatte C., Barthélémy D., Stevenson P. (2012). The genus Cecropia: a biological clock to estimate the age of disturbed areas in the Neotropics. Plos one 7 (8).
  • 2011:

  • - Hibert F., Sabatier D., Andrivot J., Scotti-Saintagne C., Gonzalez S., Prévost M.-F., Grenand P., Chave J., Caron H. & Richard-Hansen C., 2011. Botany, genetics and ethnobotany: A crossed investigation on the Elusive tapir’s diet in French Guiana. Plos One, 6(10): e25850. [Article]
  • - Rutishauser E., D. Barthélémy, L. Blanc, E. Nicolini. 2011. Crown fragmentation assessment in tropical trees: Method, insights and perspectives. For. Ecol. Manag. 261, 400–407.
  • 2010 :

  • - Rutishauser E., Wagner F., Herault B., Nicolini E. & Blanc L., 2010. Above-ground biomass dynamic in a rainforest of eastern South America. Journal of Vegetation Science, 21(4): 672 – 682. [Article]

 

  • 2009 :

  • - Coste S., Roggy J.C., Garraud L., Heuret P., Nicolini E., Dreyer E. 2009. Does ontogeny modulate irradiance-elicited plasticity of leaf traits in saplings of rain-forest tree species? A test withDicorynia guianensis and Tachigali melinonii (Fabaceae, Caesalpinioideae). Annals of Forest Science, 66 (7).
  • - Delprete P. G., 2009. Taxonomic history, morphology, and reproductive biology of the tribe Posoquerieae (Rubiaceae, Ixoroideae) . Annals of the Missouri Botanical Garden, 96 (6) : 79-89. [Article]

 

 

Financement en cours :

 

  • Appels d’offre nationaux et internationaux :
  • - ANR
  • - UE
  • - PO/FEDER
  • - Agropolis fondation, etc.