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Institut Pasteur de la Guyane, laboratoire de virologie

Discipline : Virologie

Mots-clés : CNR, arbovirus, virus influenza, hantavirus, dengue, santé publique, surveillance épidémiologique, fièvre jaune, expertise virologique, InVS, CIRE, CVS, DSDS, OPS, culture cellulaire, biologie moléculaire, détection d’antigènes et d’anticorps, ELISA, virus Mayaro.

Personnel de l’équipe résident en Guyane :

 

  • Chercheurs et enseignants-chercheurs :
  • - Dominique ROUSSET, Médecin biologiste, PhD                     drousset@pasteur-cayenne.fr
  • - Séverine MATHEUS, IR, PhD                                              smatheus@pasteur-cayenne.fr
  • - Antoine ENFISSI, IR, PhD                                                       aenfissi@pasteur-cayenne.fr

 

  • Doctorants :
  • - Viridiana Sistek, PhD                                                           vsistek@pasteur-cayenne.fr

 

  • Techniciens et Personnel administratif :
  • - Bhety Labeau, technicienne
  • - David Moua, technicien
  • - Laetitia Bremand, technicienne
  • - Norma Thomas, secrétaire

 

 

Thème de recherche :

 

  • Description des thèmes de recherche :
  • Le laboratoire de virologie de l’Institut Pasteur de la Guyane (IPG) héberge 3 Centres Nationaux de Référence (CNR) respectivement pour les Arbovirus, les virus Influenzae et les Hantavirus pour le mandat 2012-2016.
  • Nommés par le Ministère de la Santé pour des mandats de 5 ans, ces CNR ont pour mission, pour la région Antilles-Guyane et dans leur domaine d’expertise, d’assurer une surveillance virologique avec caractérisation des virus circulants, de contribuer à la surveillance épidémiologique, et d’apporter expertise et conseil aux autorités de santé. Le laboratoire de Virologie, de part ces activités de surveillance au niveau régional est à ce jour clairement identifié par les organismes régionaux, notamment l’Organisation Panaméricaine de la Santé (OPS).

 

  • Pour répondre à ces missions, le CNR des arbovirus par exemple, dispose d’un panel d’outils de diagnostic virologiques et sérologiques pour détecter un large éventail d’arbovirus d’intérêt médical dont les principaux appartiennent à la famille des Flaviviridae (dengue, fièvre jaune) et Togaviridae (virus tonate, mayaro ou chikungunya).
  • Ces moyens diagnostiques ont, entre autres permis de mettre en évidence les épidémies de dengue survenues depuis ces 15 dernières années dans le département, de diagnostiquer en 1998 le premier cas de fièvre jaune en Guyane depuis 1902 et de détecter la présence du virus Mayaro. Plus récemment, grâce à des travaux menés sur l’émergence des hantavirus en Guyane, le laboratoire a pu objectiver la circulation de ce virus en Guyane et ainsi mettre en place des outils de diagnostic pour leur identification.

 

  • Outre ses missions de surveillance épidémiologique et d’expertise, le laboratoire de virologie développe des programmes de recherche, principalement axés sur la thématique de la dengue. A ce titre, le laboratoire participe à la caractérisation sur le plan moléculaire des différentes souches de dengue circulant dans les trois DFA à travers des projets collaboratifs développés avec des partenaires régionaux, internationaux et métropolitains. Il participe également à divers programmes de recherche sur la dengue visant au développement ou à la validation de nouveaux outils diagnostiques. Enfin, le laboratoire de virologie, fort de l’expertise acquise sur les hantavirus, virus émergents dans les Amériques, focalise ces efforts sur la mise en place de nouveaux outils de diagnostic visant à identifier d’autres virus à potentiel émergent ou réémergents à l’origine de syndromes viraux graves non étiquetés.

 

 

Partenariat et réseaux :

  • - InVS
  • - ARS

 

 

Publications significatives :

  •  2014

- Bonduelle O, Carrat F, Luyt CE, Leport C, Mosnier A, Benhabiles N, Krivine A, Rozenberg F, Yahia N, Samri A, Rousset D, van der Werf S, Autran B, Combadiere B.(2014)Characterization of pandemic influenza immune memory signature after vaccination or infection.J Clin Invest. 2014 Jul 1;124(7):3129-36.[article]

- Demanou M, Pouillot R, Grandadam M, Boisier P, Kamgang B, Hervé JP, Rogier C, Rousset D, Paupy C. (2014) Evidence of dengue virus transmission and factors associated with the presence of anti-dengue virus antibodies in humans in three major towns in cameroon.PLoS Negl Trop Dis. 2014 Jul 10;8(7):e2950 [article]

- Lavergne A, de Thoisy B, Donato D, Guidez A, Matheus S, Catzeflis F, Lacoste V.(2014) Patawa Virus, a New Arenavirus Hosted by Forest Rodents in French Guiana. Ecohealth. 2014 Sep 13.

- de Thoisy B, Matheus S, Catzeflis F, Clément L, Barrioz S, Guidez A, Donato D, Cornu JF, Brunaux O, Guitet S, Lacoste V, Lavergne A. (2014)Maripa hantavirus in French Guiana: phylogenetic position and predicted spatial distribution of rodent hosts. Am J Trop Med Hyg. 2014 Jun;90(6):988-92.

- Matheus S, Pham TB, Labeau B, Huong VT, Lacoste V, Deparis X, Marechal V.(2014)Kinetics of dengue non-structural protein 1 antigen and IgM and IgA antibodies in capillary blood samples from confirmed dengue patients.Am J Trop Med Hyg. 2014 Mar;90(3):438-43.

- Sadeuh-Mba SA, Bessaud M, Joffret ML, Endegue Zanga MC, Balanant J, Mpoudi Ngole E, Njouom R, Reynes JM, Delpeyroux F, Rousset D. (2014) Characterization of Enteroviruses from non-human primates in cameroon revealed virus types widespread in humans along with candidate new types and species. PLoS Negl Trop Dis. 2014 Jul 31;8(7):e3052 [article]

- Van Bortel W, Dorleans F, Rosine J, Blateau A, Rousset D, Matheus S, Leparc-Goffart I, Flusin O, Prat C, Cesaire R, Najioullah F, Ardillon V, Balleydier E, Carvalho L, Lemaître A, Noel H, Servas V, Six C, Zurbaran M, Leon L, Guinard A, van den Kerkhof J, Henry M, Fanoy E, Braks M, Reimerink J, Swaan C, Georges R, Brooks L, Freedman J, Sudre B, Zeller H.(2014) Chikungunya outbreak in the Caribbean region, December 2013 to March 2014, and the significance for Europe.Euro Surveill. 2014 Apr 3;19(13)

  • 2013

- Mahamat A, Dussart P, Bouix A, Carvalho L, Eltges F, Matheus S, Miller MA, Quenel P, Viboud C.(2014) Climatic drivers of seasonal influenza epidemics in French Guiana, 2006-2010.J Infect. 2013 Aug;67(2):141-7.

- Berthet N, Paulous S, Coffey LL, Frenkiel MP, Moltini I, Tran C, Matheus S, Ottone C, Ungeheuer MN, Renaudat C, Caro V, Dussart P, Gessain A, Desprès P. (2014)Resequencing microarray method for molecular diagnosis of human arboviral diseases.J Clin Virol. 2013 Mar;56(3):238-43.

  • 2012

- Barrau M, Larrieu S, Cassadou S, Chappert JL, Dussart P, Najioullah F, Matheus S, Renner J, Gasc C, Quenel P, Ledrans M. (2012)Hospitalized cases of influenza A(H1N1)pdm09 in the French territories of the Americas, July 2009-March 2010. Rev Panam Salud Publica. 2012 Aug;32(2):124-30.

- Matheus S, Chappert JL, Cassadou S, Berger F, Labeau B, Bremand L, Winicki A, Huc-Anais P, Quénel P, Dussart P. Virological surveillance of dengue in Saint Martin and Saint Barthélemy, French West Indies, using blood samples on filter paper. Am J Trop Med Hyg. 2012 jan 86(1):159-165. [Article]

- Matheus S, Lavergne A, de Thoisy B, Dussart P, Lacoste V. Complete genome sequence of a novel hantavirus variant of Rio Mamore virus, Maripa virus, from French Guiana. J Virol. 2012 Mai; 86(9):5399. [Article]

  • 2011

-Matheus S, Djossou F, Moua D, Bourbigeot AM, Hommel D, Lacoste V, Dussart P, Lavergne A. Hantavirus pulmonary syndrome, French Guiana. Emerg. Infect. Dis. 2010; 16 (4): 739-741. [Article]
- Nunes MR, Neto JP, Casseb SM, Nunes KN, Martins LC, Rodrigues SG, Matheus S, Dussart P, Casseb LM, Vasconcelos PFC. Evaluation of an Immunoglobulin M-specific capture enzyme-linked immunosorbent assay for rapid diagnosis of dengue infection. JVM. 2011; 171(1): 13-21. [Article]

  • 2009

-Binh PT, Matheus S, Huong VT, Deparis X, Marechal V. Early clinical and biological features of severe clinical manifestations of dengue in Vietnamese adults. J. Clin. Virol. 2009 ; 45 (4): 276-80.[Article]
- Carme B, Matheus S, Donutil G, Raulin O, Nacher M, Morvan J. Concurrent dengue and malaria in Cayenne Hospital, French Guiana. Emerg. Infect. Dis. 2009 ; 15 (4): 668-71. [Article]
- Deparis X, Maréchal V, Matheus S. Mécanismes physiopathologiques de la dengue : revue critique des hypothèses. Med Trop, 2009.Aug ;69(4):351-7. [Article]
- Meynard JB, Ardillon V, Venturin C, Ravachol F, Basurko C, Matheus S, Gaborit P, Grenier C, Dussart P, Quenel P. First description of a dengue fever outbreak in the interior of French Guiana, February 2006. Eur J Public Health. 2009 ; 19 (2): 183-188.. [Article]

  • 2008

- Matheus S, Meynard JB, Lavergne A, Girod R, Moua L, Labeau B, Dussart P, Lacoste V, Deparis X. Dengue-3 outbreak in Paraguay: Investigations using capillary blood samples on filter paper. Am J Trop Med Hyg. 2008; 79 (5): 685-687. [Article]

Financement en cours :

 

  • Programme CMFdeng : 
  • Conséquences materno-foetales de la dengue symptomatique chez la femme enceinte en Guyane
  • Porteur du projet : CIC-EC/CHAR
  • Subvention FEDER : 262 522 euros (subvention allouée au laboratoire de virologie IP Guyane : 45 000 euros)
  • Date de début : Septembre 2012
  • Date de fin : Septembre 2015

 

  • Programme EMERGUY :
  • Emergences virales en Guyane
  • Porteur du projet : Laboratoire de virologie IP Guyane
  • Subvention FEDER : 288 322 euros
  • Date de début : Mars 2013
  • Date de fin : Septembre 2016